Conservar las dos pistas de audio y subtitulos con Avidemux

Hola muchachos

Al quitar los anuncios de los .ts con el Avidemux siguiendo el tutorial del foro, en los archivos con dos audios, el programa da a elegir uno de ellos. La pregunta es si no se pueden dejar los dos. Además me gustaría poder conservar también los subtítulos cuando los trae el .ts. No sé si es posible. Si me podéis echar una mano os lo agradezco.

Gracias de antemano.